Operasyon lokal anestezi ile gerçekleşir. Başın arka kısmından ihtiyaç duyulan miktarda saç kökleri mikro uçlar yardımıyla alınır. Saç ekimi yapılacak bölgeye mikro delikler açılır. Açılan deliklere mikro pensetler ile saç kökleri yerleştirilir FUE yönteminin özelliği saç derisinde kesi yapılmamasıdır; bu durum da hem operasyon esnasında hem de iyileşme sürecinde avantaj sağlar.

Ayrıca operasyon sonrasında yara ve kesi izi kalmayacak olması da hastalar açısından tercih edilmesini artırır.